Cette période dure environ 3 mois. Le patient vient une fois par semaine à l'hôpital afin d'être examiné, de vérifier l'absence d'infection, de réaction du greffon contre l'hôte ou d'autres problèmes, et de bien équilibrer les traitements.

Pendant cette période, le risque de complications reste élevé et toute anomalie (fièvre, toux, diarrhée, etc) doit être immédiatement signalée. Des re-hospitalisations sont parfois nécessaires afin de traiter des infections.

A l'issue de cette période, un bilan complet est réalisé afin d'évaluer le bon fonctionnement du greffon, l'immunité du patient et le bon fonctionnement des autres organes (cœur, poumon, etc).

Cette période peut parfois durer plus longtemps si une surveillance est toujours nécessaire ou si des traitements doivent être administrés.

Le patient est par la suite suivi en consultation